Органами управления Центра являются наблюдательный совет Центра, общее собрание работников Центра, педагогический совет, совет Центра.
Непосредственное управление Центром осуществляет директор.
Трудовой договор с директором Центром заключается на основе типовой формы трудового договора, утверждаемой Правительством Российской Федерации с учетом мнения Российской трехсторонней комиссии по регулированию социально-трудовых отношений.